Кафедра неонатологии была основана в январе 1994 года решением Ученого совета института, и её руководство возложено на кандидата медицинских наук А.В. Вахидова. На протяжении с 1994 по 1999 годы на кафедре работали к. м. н Атаханова М.Т., к. м. н Махкамов К.К., ассистенты Нестеренко А.Г., Раджабова Г.С., Гайнулина К.А.

        С 1998 по 2000 годы кафедру возглавляла к.м.н. Ќадырова Р.Р. В составе кафедры работали: к.м.н. Ходжибекова Н.А., к.м.н Ахмедова М.А., к.м.н. Махкамов К.К., ассистенты Раджабова Г.С., Гайнулина К.А.

        С ноября 2001 года к. м. н, доцент Саидму ее составе осуществляли свою деятельность д.м.н., Вахидов А.В., доцент к.м.н. Ходжибекова Н.А., к.м.н. Махкамов К.К., к.м.н. Бузрукова Н .Д., ассистенты Раджабова Г.С., Гайнулина К.А.

В настоящее время на основании решения Ученого совета института и приказа ректора института от 07.05.2013 года (№97) заведующим кафедрой неонатологии назначен к. м. н, доцент Махкамов Қ.Қ. Профессорско-преподавательский состав кафедры включает д.м.н., Вохидов А.В., доцент к.м.н. Ходжибекова Н.А., доцент к.м.н Саидмуродова Р.Х., к.м.н. Бузрукова Н .Д.

Основными клиническими базами кафедры являются отделения совместного пребывания «Мать и дитя — 1 », «Мать и дитя — 2 », отделение реанимации и интенсивной терапии новорожденных городского родильного дома №3 Управления здравоохранения местного исполнительного органа государственной власти города Душанбе и отделение патологии новорожденных Национального медицинского центра Министерства здравоохранения и социальной защиты населения Республики Таджикистан.

Заведующий кафедрой Махкамов К.К. ежедневно консультирует новорожденных отделения реанимации и интенсивной терапии и в отделениях совместного пребывания «Мать и дитя-1» и «Мать и дитя-2».

Махкамов К.К — является членом: Ученого совета института, Центрального научно-методического Совета института; межкафедральной проблемно-экспертной комиссии по общественным и терапевтическим дисциплинам института, главным внештатным специалистом Управления здравоохранения местного исполнительного органа государственной власти города Душанбе

Саидмуродова Р.Х. — к.м.н., доцент кафедры, является консультантом отделения совместного пребывания «Мать и дитя-1» городского родильного дома №3.

Ходжибекова Н.А. — к.м.н., доцент кафедры, является консультантом отделения патологии новорожденных Национального медицинского центра Министерства здравоохранения и социальной защиты населения Республики Таджикистан.

Бузрукова Н.Дж. — к.м.н., ассистент кафедры, является членом Центрального научно-методического Совета института, консультантами отделения совместного пребывания «Мать и дитя -2» городского родильного дома №3.

На кафедре ежегодно проводится подготовка и переподготовка врачей-неонатологов и медицинских сестер по уходу за новорожденными осуществляется по циклам специализации, клинической ординатуры, магистратуры, интернатуры и тематического усовершенствования, согласно календарного плана. Также выполняются внеплановые и выездные циклы.

Обучение проводится согласно разработанных сотрудниками кафедры 13 учебных программ, утвержденных Центральным научно-методическим Советом института, МЗ и СЗН РТ и МО и Н РТ.

Лекционный, семинарский и практический материал по разделам, включенных в рабочие программы, отражен в 1120 тестовых и 360 предтестовых вопросах, по контролю базисных, промежуточных и заключительных знаний слушателей. Также, контроль и оценка освоенного материала, осуществляется путем проведения промежуточного и заключительного практического экзамена OSKE по 22 станциям (15 для врачей и 7 для медицинских сестер).

В настоящее время научной тематикой кафедры является «Современные резервы повышения качества выхаживания детей, родившихся с низкой массой тела». Установлена зависимость качества выхаживания маловесных детей от соблюдения стандартов лечения, в частности: принципов оказания первичной помощи, профилактики геморрагической болезни, болевого синдрома и холодового стресса, рациональной оксигено и антибиотикотерапии, постуральной поддержки и принципов гуманизации неонатальной помощи, сохранения грудного вскармливания, включая должную лабораторную и инструментальную диагностику. Установлена зависимость адекватности реанимации и интенсивной терапии от оснащенности медицинских учреждений необходимой аппаратурой, медикаментами, вспомогательными средствами. Результаты научных исследований отражены в 36 печатных работах.

Основными клиническими базами кафедры являются отделения совместного пребывания «Мать и дитя — 1 », «Мать и дитя — 2 », отделение реанимации и интенсивной терапии новорожденных городского родильного дома №3 Управления здравоохранения местного исполнительного органа государственной власти города Душанбе и отделение патологии новорожденных Национального медицинского центра Министерства здравоохранения и социальной защиты населения Республики Таджикистан.